2007 február 1-től módosult az Aggteleki Nemzeti Park Igazgatóság működési területe. A változásokról a környezetvédelmi, természetvédelmi, vízügyi hatósági és igazgatási feladatokat ellátó szervek kijelöléséről szóló 347/2006. (XII. 23.) Kormányrendelet rendelkezik.
A korábban a Bükki Nemzeti Park Igazgatóság működési területén lévő, egyedi jogszabállyal védetté nyilvánított országos jelentőségű védett természetek közül a Tokaj-Bodrogzug Tájvédelmi Körzet, a Zempléni Tájvédelmi Körzet, továbbá a Bodrogszegi Várhegy Természetvédelmi Terület, az Erdőbényei-fáslegelő Természetvédelmi Terület, a Füzérradványi park Természetvédelmi Terület, a Long-erdő Természetvédelmi Terület, a Megyaszói-tátorjános Természetvédelmi Terület, a Megyer-hegyi Tengerszem Természetvédelmi Terület, a Sóstói-legelő Természetvédelmi Terület és a Tállyai Patócs-hegy Természetvédelmi Terület az Aggteleki Nemzeti Park működési területére került át.
Azóta védetté nyilvánított új TT-k: Abaújkéri Aranyos-völgy TT, Tarcali Turzó-dűlő TT.
Ha nagyobb méretben szeretné megtekinteni, kattintson a képre.
A Kormányrendelet az Aggteleki Nemzeti Park Igazgatóság működési területét 2007. február 1-i hatállyal az alábbiak szerint állapítja meg:
Borsod-Abaúj-Zemplén megye területéből a Sajó, a Hernád és az országhatár által bezárt terület, továbbá
| Abaújalpár | Füzér | Legyesbénye | Sima |
| Abaújkér | Füzérkajata | Mád | Sóstófalva |
| Abaújszántó | Füzérkomlós | Makkoshotyka | Szegi |
| Abaújvár | Füzérradvány | Megyaszó | Szegilong |
| Alsóberecki | Gesztely | Mezőzombor | Szentistvánbaksa |
| Alsódobsza | Golop | Mikóháza | Szerencs |
| Alsóregmec | Gönc | Mogyoróska | Tállya |
| Arka | Göncruszka | Monok | Tarcal |
| Baskó | Györgytarló | Nagyhuta | Telkibánya |
| Bekecs | Háromhuta | Nagykinizs | Tiszacsermely |
| Bodroghalom | Hejce | Nagyrozvágy | Tiszakarád |
| Bodrogkeresztúr | Hercegkút | Nyíri | Tiszaladány |
| Bodrogkisfalud | Hernádbűd | Olaszliszka | Tokaj |
| Bodrogolaszi | Hernádcéce | Pácin | Tolcsva |
| Boldogkőújfalu | Hernádkércs | Pálháza | Újcsanálos |
| Boldogkőváralja | Hollóháza | Pányok | Vágáshuta |
| Bózsva | Karcsa | Pere | Vajdácska |
| Cigánd | Karos | Pusztafalu | Vámosújfalu |
| Dámóc | Kéked | Rátka | Vilmány |
| Erdőbénye | Kenézlő | Regéc | Vilyvitány |
| Erdőhorváti | Kishuta | Révleányvár | Viss |
| Felsőberecki | Kisrozvágy | Ricse | Vizsoly |
| Felsődobsza | Komlóska | Sárazsadány | Zalkod |
| Felsőregmec | Korlát | Sárospatak | Zemplénagárd |
| Filkeháza | Kovácsvágás | Sátoraljaújhely | Zsujta |
| Fony | Lácacséke | Semjén |